MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017439	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017439	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017439	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017439	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017439	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017439	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017439	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017439	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017439	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017439	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017439	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017439	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017439	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017439	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017439	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017439	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017439	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017439	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017439	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017439	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017439	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017439	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017439	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017439	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017439	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017439	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017439	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017439	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017439	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017439	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017439	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017439	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017439	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017439	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017439	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017439	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017439	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017439	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017439	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017439	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017439	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017439	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017439	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017439	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017439	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017439	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017439	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017439	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017439	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017439	ATG	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017439	A	6	6	9131	9136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017439	TTC	3	9	9176	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017439	ATC	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017439	A	6	6	9216	9221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017439	GAA	2	6	9230	9235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017439	A	6	6	9286	9291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017439	TATT	2	8	9310	9317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017439	CCT	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017439	TAG	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017439	AGAA	2	8	11202	11209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017439	CTT	2	6	11242	11247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017439	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017439	TCA	2	6	11279	11284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017439	T	6	6	11299	11304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017439	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017439	AAT	2	6	11329	11334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017439	TA	3	6	13329	13334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017439	ATT	2	6	13363	13368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017439	AAG	2	6	13380	13385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017439	TTA	2	6	13406	13411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017439	AAGG	2	8	13428	13435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017439	AAG	2	6	13440	13445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017439	AAC	2	6	13524	13529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017439	TA	4	8	13553	13560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017439	CTT	2	6	14947	14952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017439	CAAA	2	8	16062	16069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017439	AG	3	6	17505	17510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017439	GA	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017439	GTT	2	6	17620	17625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017439	GAA	2	6	18364	18369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017439	AAT	3	9	18428	18436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017439	CT	3	6	18440	18445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017439	TCT	2	6	18456	18461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017439	TGCG	2	8	18516	18523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017439	CTT	3	9	19882	19890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017439	T	6	6	19889	19894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017439	T	6	6	19896	19901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017439	A	6	6	20544	20549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017439	CCT	2	6	20555	20560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017439	GGA	2	6	20601	20606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017439	AGA	3	9	20641	20649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017439	GA	3	6	20664	20669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017439	TGG	2	6	20860	20865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017439	AAC	2	6	20899	20904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017439	AGC	2	6	20916	20921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017439	AGG	2	6	21005	21010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017439	TGA	2	6	21117	21122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017439	AG	3	6	21181	21186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017439	TCC	2	6	21234	21239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017439	CT	3	6	21249	21254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017439	CGCT	2	8	21257	21264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017439	TTAA	2	8	21278	21285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017439	GTTA	2	8	21315	21322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017439	GATC	2	8	21370	21377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017439	AAT	2	6	21409	21414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017439	A	7	7	24549	24555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017439	TTA	2	6	24562	24567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017439	T	9	9	24577	24585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017439	GA	3	6	26501	26506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017439	CT	3	6	26508	26513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017439	ACT	2	6	26516	26521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017439	A	6	6	26532	26537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017439	T	7	7	26544	26550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017439	T	7	7	27858	27864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017439	TAA	2	6	27869	27874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017439	TC	3	6	27876	27881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017439	ATTG	2	8	27927	27934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017439	AG	3	6	27959	27964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017439	AGA	2	6	27981	27986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017439	AAAGA	2	10	33081	33090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017439	CTG	2	6	33110	33115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017439	GA	3	6	36373	36378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017439	T	9	9	36407	36415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017439	CTT	2	6	36467	36472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017439	AT	3	6	36475	36480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017439	CT	3	6	38742	38747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017439	TAA	2	6	38805	38810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017439	T	6	6	38825	38830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017439	AAG	2	6	38846	38851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017439	A	7	7	40103	40109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017439	CT	3	6	40112	40117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017439	T	6	6	40117	40122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017439	CTC	2	6	40123	40128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017439	AAG	2	6	40208	40213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017439	T	8	8	40298	40305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017439	CT	3	6	42304	42309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017439	TGCAA	2	10	42315	42324	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017439	A	6	6	42569	42574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017439	GA	5	10	42579	42588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017439	A	7	7	42618	42624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017439	CAAAA	2	10	42633	42642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017439	A	7	7	42639	42645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017439	GAT	2	6	42663	42668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017439	AAG	2	6	42669	42674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017439	AG	3	6	42703	42708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017439	A	6	6	42709	42714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017439	GGA	2	6	42721	42726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017439	TAA	2	6	42819	42824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017439	TC	3	6	43795	43800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017439	TGTT	2	8	43804	43811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017439	A	8	8	43843	43850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017439	AATA	2	8	44043	44050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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